Informações
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Informações para Candidatos à Orientação
O Projeto Cyclops
O Projeto Cyclops é um projeto de pesquisas internacional, realizado em cooperação com universidades do Brasil e da Alemanha e instituições médicas e da indústria de ambos os países. O nosso objetivo é o desenvolvimento de novas tecnologias de informação aplicadas à medicina e o nosso grupo é organizado segundo modelos de organização e condução de atividades de pesquisa de grupos de pesquisa internacionais.
Áreas em Oferta
- Modelagem de Conhecimento em Anatomia, Fisiologia e Patologia
- Processamento de Imagens aplicado à Medicina
- Processamento de Voz Aplicado à Medicina
- Processamento de Imagens aplicado à Bioinformática
- Telemedicina
Temas
Tema #1 - Modelagem do Crescimento do Córtex Cerebral Utilizando Modelos Fractais
O objetivo deste trabalho é simular o crescimento do tecido cerebral humano e as formas como determinadas regiões se especializam. Utilizaremos técnicas baseadas em Fractais e também alguns trabalhos similares como A Primal Sketch of the Cortex Mean Curvature: a Morphogenesis Based Approach to Study the Variability of the Folding Patterns.
Tema #2 - Implementação de um Método de Análise de Imagens para Automatização do TESTE COMETA para Avaliação de Dano em DNA
O teste cometa é um teste realizado com lâminas histopatológicas e verifica o nível de dano ao DNA das células. Os passos iniciais são a aquisição das lâminas, a coloração destas com agentes químicos especiais e a aquisição de imagens com um microscópio acoplado a uma câmera CCD. Cada lâmina é preparada para conter em média 50 núcleos de células.
Dependendo de como os núcleos
de células coloridos se apresentam ao microscópio, se realiza
um cálculo de índice de dano de DNA:
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Índice de dano ao DNA: [(cometas classe 1 x 0) + (cometas classe 2 x 1) + (cometas classe 3 x 2) + (cometas classe 4 x 3) + (cometas classe 5 x 4)].
O objetivo deste trabalho é automatizar o processo de avaliação de cada um dos aproximadamente 50 núcleos de células que se encontram em cada lâmina através do desenvolvimento de um conjunto de técnicas de análise de imagens que permita classificar os núcleos um a um em uma das 5 classes exemplificadas acima.
Feito isto, deve-se desenvovler um sistema que integre essas técnicas e permita estabelecer automaticamente o índice de dano de DNA para cada lâmina apresentada.
Este sistema será utilizado experimentalmente na avaliação de bacias fluvias para determinação de contaminação por poluentes mutagênicos.
Tema #3 - Implementação de uma infraestrutura de Reconhecimento de Voz para Ditados de Laudos Médicos através da utilização de Computadores de Mão e Redes Wireless
O Projeto Cyclops desenvolveu
um front-end Web que permite que imagens médicas em formato DICOM
e laudos médicos estruturados em formato DICOM Structured Reporting
sejam consultados a partir de um Servidor DICOM e visualizados em um computador
de mão (iPAQ) via rede Wireless (WaveLAN). Isto permite acesso a
dados médicos em qualquer lugar de um hospital com um Prontuário
Eletrônico de Paciente baseado no padrão médico internacional
DICOM Strcutured Reporting e uma rede WaveLAN instalada, como por exemplo
diretamente ao pé do leito do paciente internado, permitindo que
todo seu prontuário esteja à dispsição do médico
que realiza a visita.
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O nosso objetivo neste trabalho é:
- Implementar uma extensão do servidor DICOM que permita armazenamento de ditados médicos em formato MP3 encapsulado como DICOMWaveform;
- Implementar um software que permita ao médico realizar o laudo de exames ou então a prescrição médica diretamente através de ditado ao equipamento iPAQ e posterior armazenamento automático destes ditados em formato DICOM Waveform no servidor DICOM através da rede wireless;
- Implementar um software de reconhecimento de voz que permita ao servidor DICOM realizar a transcrição automática do laudo ditado para laudo em texto e posterior utilização de um conversor de texto corrido para laudos DICOM SR já implementado no Projeto Cyclops.
Tel.: +55-48-331 7552/9498
FAX: +55-48-331-9770
awangenh@inf.ufsc.br
